Program Magister Program Studi Teknik Biomedis ditempuh dalam empat (4) semester dengan 44 sks untuk memperoleh gelar M.Sc.
Jenis Program yang ditawarkan adalah:
- Program REGULER
Program regular ini terdiri dari program by course (berbasis kuliah) dan by research (berbasis penelitian)
- Program REGULER (by course), 44 sks terdiri dari 21 sks matakuliah WAJIB, 15 sks matakuliah PILIHAN dan 8 sks TESIS
- Program REGULER (by research), 44 sks terdiri dari: 12 sks matakuliah WAJIB, 8 sks TESIS, dan 24 sks terkait Penelitian, Seminar, Publikasi Ilmiah
- Program FAST TRACK
Program FAST TRACK ini dari input mahasiswa unggul S1 Fakultas Teknik UGM. Dalam waktu 5 tahun studi akan mendapatkan gelar S1 dan S2.